Pro přenos souborů lze použít zabezpečené protokoly SFTP/SCP.

Postup pro OS Windows:

• Na stránkách http://winscp.net/ je k dispozici aplikace WinSCP,
  SFTP klient a FTP klient s otevřeným kódem (tzv. open source) pro Windows.

• Obdobně jako v návodu pro přenos na HomeL lze ve správci souborů Salamander jednoduše za pomoci modulu  SFTP/SCP Client (WinSCP) kopírovat soubory na server.

• Volně šiřitelný textový klient pscp je k dispozici na adrese:
  http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/download.html.

Postup pro OS Linux:

• SFTP lze použít jakýkoli klient s podporou SFTP, například FileZilla. Nastavení je potom obdobné jako u klienta Salamander pro windows.
• SSHFS

1. Nainstalovat nástroj sshfs, např. v distribucích Ubuntu/Debian příkazem:
    sudo apt-get install sshfs 
    
2. Vytvořit ve svém domovském adresáři přípojný adresář a příkazem sshfs do něj připojit vzdálený adresář z hostingového serveru:
    mkdir ~/projekt 
   
   (podle serveru: )
    sshfs login@webmel53.vsb.cz:nazev_projektu/www ~/projekt 
    sshfs login@webmel55.vsb.cz:nazev_projektu/www ~/projekt 
   
   Jako login je třeba použít SSO uživatelské jméno. Heslo bude následně vyžádáno.
    
3. Po úspěšném přihlášení je serverový adresář obsahující soubory projektu připojen do podadresáře projekt domovského adresáře daného uživatele, kde lze online měnit soubory, např. pomocí těchto příkazů:
   
   • synchronizace:
      rsync -av --no-g /zdrojovy/adresar/ ~/projekt 
   • editace:
      vim ~/projekt/index.html 
   • porovnání:
      vimdiff ~/zdrojovy/adresar/index.html ~/projekt/index.html 
      
4. Odpojit od serveru se lze příkazem:
    sudo umount ~/projekt